Illumina

MiSeq System

MiSeq System

Compact benchtop sequencer for targeted and small genome sequencing with 4–56h run time.

APPLICATIONS

Compact benchtop NGS with PE300 for targeted sequencing.

From 16S metagenomics to clinical panels with proven SBS chemistry.

Targeted Gene Panels & Clinical Oncology

Output 0.3–15Gb + PE300 read length ideal untuk cancer hotspot panels, AmpliSeq Cancer Hotspot v2, dan TruSeq Custom Amplicon. Sample input rendah 50 pg cocok untuk FFPE dan biopsy klinis terbatas.

16S Metagenomics & Microbiome Analysis

MiSeq v3 600-cycle kit menghasilkan 25M PE reads untuk sekuensing region V3-V4 16S rRNA. >80% bases >Q30 pada 2x150 menjadikannya standar emas dunia untuk diversity profiling mikroba dan lingkungan.

Small Whole Genome Sequencing

PE300 read length + output 15Gb memungkinkan assembly bakteri, virus, fungi, dan plasmid. Run time 56h untuk 2x300 cocok untuk outbreak tracking, AMR surveillance, dan reference-guided assembly.

Amplicon Sequencing & Sanger Validation

MiSeq Micro Kit 1.2Gb untuk QC cepat konstruksi klon dan validasi PCR amplicon. Nextera XT kit dengan input 1 ng + hands-on <90 menit mempercepat library prep untuk verifikasi mutasi target.

HLA Typing & Transplant Genomics

PE300 long reads meningkatkan akurasi phasing alel HLA kompleks. Output 15Gb cukup untuk high-resolution HLA typing panel klinis dengan reproducibilitas tinggi dan data analysis via BaseSpace.

Compact Clinical Lab Workflow

Footprint 68.6 x 56.5 cm + bobot 57 kg ideal untuk hospital dan diagnostic lab. 10" touchscreen + on-board MiSeq Reporter untuk push-button analysis tanpa server bioinformatika tambahan.

Overview

MiSeq System adalah benchtop sequencer pertama dari Illumina untuk targeted dan small genome applications. Dilengkapi proven SBS chemistry, 1–25M reads per run, dan output 0.3–15Gb. PE300 read length terpanjang di kelas benchtop. Integrated analysis workflows via MiSeq Reporter + BaseSpace dan push-button operation membuatnya ideal untuk targeted panels, 16S metagenomics, small whole genomes, amplicon sequencing, dan HLA typing. Fastest turnaround untuk clinical labs dengan sample input rendah 50 pg – 1 µg.

Specifications

Sequencing Technology Sequencing by Synthesis - SBS
Flow Cell Type Standard single flow cell
Max Reads per Run 25M single reads, 50M paired-end reads
Read Length SE36, SE50, PE150, PE250, PE300
Output per Run 0.3–15 Gb
Run Time 4h for 4M reads 1x36, 56h for 25M reads 2x300
Quality Score >80% bases higher than Q30 at 2x150
Applications Targeted panels, 16S metagenomics, small WGS, amplicon seq, HLA typing
Sample Input 50 pg – 1 μg DNA/RNA
Instrument Control 10" Touchscreen
Dimensions 68.6 x 56.5 x 52.3 cm (W x D x H)
Weight 57 kg
Data Analysis On-board MiSeq Reporter + BaseSpace
Connectivity Ethernet, USB
Power Requirements 100–240 VAC, 50/60 Hz, 750W max

Complete Your Workflow

Optimized consumables and reagents for MiSeq System

Reagent Kits

MiSeq Reagent Kit v2 (300-cycle)

SKU: MS-102-2002

Kit reagen standar untuk menghasilkan hingga 15 juta klaster pembacaan, dioptimalkan untuk sekuensing genom kecil, panel target, dan aplikasi ekspresi gen umum.

Chemistry Version: v2 Chemistry
Maximum Cycles: 300 cycles
Output Capacity: Up to 4.5 - 5.1 Gb
Reagent Kits

MiSeq Reagent Kit v3 (600-cycle)

SKU: MS-102-3003

Kit dengan siklus terpanjang dan densitas klaster tertinggi (hingga 25 juta pasang pembacaan), menjadi standar emas dunia untuk analisis keanekaragaman mikroba 16S metagenomik.

Chemistry Version: v3 Chemistry
Maximum Cycles: 600 cycles
Output Capacity: Up to 13.2 - 15.0 Gb
Reagent Kits

MiSeq Reagent Micro Kit v2 (300-cycle)

SKU: MS-103-1002

Versi kit v2 skala ekonomis dengan keluaran jumlah read lebih rendah, ideal untuk verifikasi cepat konstruksi klon plasmid atau sekuensing amplikon skala kecil.

Chemistry Version: v2 Micro Format
Maximum Cycles: 300 cycles
Output Capacity: Up to 1.2 Gb
Library Prep Kits

Nextera XT DNA Library Prep Kit

SKU: FC-131-1024

Kit penyiapan pustaka ultra-cepat menggunakan teknologi tagmentasi enzim transposase untuk memotong sekaligus menempelkan adaptor sekuensing pada input DNA yang sangat minim.

Technology: Transposome-mediated Tagmentation
Sample Input: 1 ng
Hands-on Time: < 90 minutes
Library Prep Kits

TruSeq Custom Amplicon Low Input

SKU: FC-134-2001

Assay penyiapan library berbasis hibridisasi probe tertarget, dirancang khusus untuk memetakan wilayah ekson kustom dari sampel dengan kualitas DNA rendah.

Application: Targeted Resequencing
Input Quality: FFPE / Low-input Optimized
Multiplex Indexing: Dual Indexing Ready
Library Prep Kits

AmpliSeq for Illumina Cancer Hotspot Panel v2

SKU: 20019161

Panel amplikon terfokus untuk mengamplifikasi dan mendeteksi variasi mutasi titik (SNV) hotspot pada 50 gen yang paling sering bermutasi di berbagai jenis kanker.

Application: Targeted Oncology Sequencing
Target Genes: 50 Cancer Hotspot Genes
Input DNA: Low-input (10 ng)

Precision is Language. Integrity is Law