Molekuler Biologi
QC DNA dan RNA.
- Konfirmasi Ukuran PCR
- QC Integritas RNA
- Plasmid Prep
- Restriction Digest
Electrophoresis adalah teknik pemisahan biomolekul bermuatan seperti DNA, RNA, atau protein berdasarkan ukuran dan muatan saat dialiri medan listrik melalui matriks gel atau kapiler.
Electrophoresis adalah teknik pemisahan biomolekul bermuatan seperti DNA, RNA, atau protein berdasarkan ukuran dan muatan saat dialiri medan listrik melalui matriks gel atau kapiler.
Untuk QC ukuran fragmen DNA/RNA, konfirmasi PCR, cek kemurnian protein, dan analisis vaksin. Metode cepat, murah, dan visual.
Ini QC rutin paling dasar di lab molekuler. LOD 1-5 ng DNA. Bisa bedakan 50 bp. Standar FDA/EMA untuk karakterisasi biologi. Hasil langsung kelihatan di gel.
Cek hasil PCR 500 bp di gel agarosa 1.5%. Band tunggal = sukses. Band ganda = non-specific. Atau QC integritas RNA 28S:18S = 2:1.
QC DNA dan RNA.
Analisis kemurnian dan ukuran protein.
Pemisahan fragmen.
| Sampel | Contoh | Tujuan |
|---|---|---|
| DNA | PCR Product, Plasmid | Agarosa gel 0.8-2%. Stain EtBr atau SYBR Safe. |
| RNA | Total RNA, mRNA | Denaturing gel atau Bioanalyzer. Cek 28S/18S ratio. |
| Protein | Mab, Lysate | SDS-PAGE. Denaturasi dengan SDS dan DTT. |
Foto gel UV atau kromatogram fluoresensi vs waktu migrasi.
DNA/RNA bermuatan negatif, protein-SDS bermuatan negatif, bermigrasi ke anoda + saat diberi tegangan 80-200V. Matriks gel agarosa atau poliakrilamida bertindak sebagai saringan molekuler. Molekul kecil jalan cepat, besar jalan lambat. Dye interkalasi atau Coomassie membuat pita terlihat di UV atau cahaya tampak.